Ich habe für mein Problem zwar keine Lösung gefunden, jedoch eine Abhilfe.
Meine Abhilfe für diesen Fall war, dass ich den Shelly der auf dem baugleichen Nachbar Raffstore A eingelernt war, auf den NOK Raffstore B montiert habe.
Den Shelly, der sich auf Raffstore B nicht einlernen lies, lies sich dann aber auf Raffstore A anlernen.
Somit habe ich beide Shellys auf einem Raffstore angelernt, setze sie aber an unterschiedlichen Raffstores ein.
Warum das einlernen, bzw. Kalibrieren nicht funktioniert hat, kann ich nicht nachvollziehen.